航空:海门市区北距南通兴东机场35公里,南距上海虹桥机场、浦东机场120公里,西距南京禄口机场200公里。都有高等级公路相连。
铁路、公路:正在兴建的南京至启东的宁启铁路、宁启高速公路位于海门市区北侧1公里。
航运:国际航运中心上海港的辅助港南通国际集装箱码头距海门市区35公里。
港口:海门港是长江北岸距上海最近,出海最便捷的天然港口,可建万吨级客货、建材、石油、船厂等码头。
越江通道工程:浦东至崇明江底隧道、崇明到海门越江大桥工程将于2003年初开工兴建。崇海大桥北桥头堡位于海门市区东侧约2公里。通道建成后,海门至上海车程仅需1小时。